工业计算机一开始就是为了让工业生产升级成自动化的生产线而诞生，因此最主要的应用领域还是自动化产业。不过随着各产业自动化的需求提升，越来越多地方需要使用工业计算机来帮助形成一套整体的控制系统。因此在应用上可说是遍地开花，除了工业制程的自动化生产线，在零售业、医疗、交通等都能看见工业计算机的踪迹，包括便利商店收银系统、自动仓储设备、与捷运自动化系统等这些与我们日常生活密切相关的应用。基本上，只要是自动化设备应用的地方就一定有工业计算机的操控。
目前物联网的呼声渐高、云端科技的浪潮席卷全球，工业计算机的应用也更加灵活多样，各家硬设备厂商无不摩拳擦掌，准备在大有前景的未来分一杯羹。例如身为全球第二大工业计算机供货商的研华科技(Adventech)在几年前投入智慧农业的领域，帮阿里山上的高山百合花农设计了可以远程监控花朵生长状况的配置，让农民免去不少长途通车的辛劳，也达成更有效的管理。
计算机通讯系统也成了近年来工业计算机主要的应用领域，随着互联网与通讯设备的整合，现在的通讯系统以开放架构的计算机取代传统电话交换机，工业计算机也有机会能大展拳脚，例如银行语音查询系统、医院预约系统等交互式语音服务(InteractiveVoiceResponse)等都是应对通讯技术的革新所产生新的需求。
在医疗方面，大型精密的医疗设备，如核磁共振、计算机断层仿真摄影、超音波诊断等，在二十多年前就已将工业计算机导入设备，而现在随着人们对医疗相关服务与产品的需求与日俱增，医院也导入了像是“自动化病床监控与医疗数据通讯系统”来协助做更有效率的医疗管理。除此之外，国防军事工业一向作为科技竞逐的标的，因为需要非常高规格的科技实力才能发展，所以也与工业计算机的发展息息相关。
而工业计算机未来的远景远不止于此，除了农业、通讯与医疗以外，无论是交通运输、城市建设、零售物流等，都是相关厂商大力发展的领域，它的应用随着科技的进展逐渐开枝散叶，值得我们拭目以待。
